Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCG1P45844 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCG1P45844 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.1 ms