Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKN2BP42772 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDKN2BP42772 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms