Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCL2P13500 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCL2P13500 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCL2P13500 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCL2P13500 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL2P13500 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL2P13500 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms