Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF3O75054 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IGSF3O75054 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms