Protein–RNA interactions for Protein: O43318

MAP3K7, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K7O43318 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP3K7O43318 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP3K7O43318 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP3K7O43318 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP3K7O43318 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms