Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP69A5D8W1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP69A5D8W1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms