Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARFGEF2Q9Y6D5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms