Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2C9

TLR6, Toll-like receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR6Q9Y2C9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TLR6Q9Y2C9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TLR6Q9Y2C9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms