Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PFDN5Q99471 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms