Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CKAP2LQ8IYA6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms