Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMM23BQ5SRD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIMM23BQ5SRD1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms