Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNNI3KQ59H18 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNNI3KQ59H18 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNNI3KQ59H18 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms