Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ME3Q16798 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ME3Q16798 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ME3Q16798 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ME3Q16798 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ME3Q16798 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
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