Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HIF1AQ16665 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIF1AQ16665 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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