Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMAD1Q15797 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMAD1Q15797 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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