Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NR1D2Q14995 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NR1D2Q14995 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms