Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SPTAN1Q13813 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPTAN1Q13813 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms