Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FCER1AP12319 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FCER1AP12319 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms