Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAD1O00515 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAD1O00515 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAD1O00515 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAD1O00515 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LAD1O00515 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAD1O00515 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAD1O00515 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAD1O00515 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAD1O00515 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAD1O00515 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAD1O00515 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms