Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF3BA8MYP8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms