Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LYVE1Q9Y5Y7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LYVE1Q9Y5Y7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms