Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCOR1Q9UKL0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR1Q9UKL0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms