Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCLK3Q9C098 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLK3Q9C098 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 626.3 ms