Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PACSIN1Q9BY11 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PACSIN1Q9BY11 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 858.1 ms