Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BBS2Q9BXC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS2Q9BXC9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BBS2Q9BXC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS2Q9BXC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS2Q9BXC9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS2Q9BXC9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS2Q9BXC9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms