Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GORASP1Q9BQQ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GORASP1Q9BQQ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms