Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CKAP2LQ8IYA6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CKAP2LQ8IYA6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms