Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ME3Q16798 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ME3Q16798 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ME3Q16798 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ME3Q16798 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ME3Q16798 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ME3Q16798 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ME3Q16798 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ME3Q16798 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME3Q16798 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME3Q16798 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME3Q16798 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ME3Q16798 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ME3Q16798 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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