Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NID2Q14112 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NID2Q14112 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NID2Q14112 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NID2Q14112 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NID2Q14112 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NID2Q14112 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NID2Q14112 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NID2Q14112 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NID2Q14112 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NID2Q14112 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NID2Q14112 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NID2Q14112 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NID2Q14112 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NID2Q14112 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NID2Q14112 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms