Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE1BQ01064 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE1BQ01064 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms