Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2C1P98194 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2C1P98194 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms