Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABCE1P61221 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABCE1P61221 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms