Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EFNA1P20827 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EFNA1P20827 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms