Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DMDP11532 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DMDP11532 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DMDP11532 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DMDP11532 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DMDP11532 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DMDP11532 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
DMDP11532 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DMDP11532 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DMDP11532 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DMDP11532 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DMDP11532 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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