Protein–RNA interactions for Protein: P04155

TFF1, Trefoil factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF1P04155 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFF1P04155 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFF1P04155 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF1P04155 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF1P04155 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF1P04155 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF1P04155 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms