Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABARAPO95166 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABARAPO95166 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms