Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DFFAO00273 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DFFAO00273 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DFFAO00273 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DFFAO00273 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DFFAO00273 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DFFAO00273 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms