Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAPGEFL1Q9UHV5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAPGEFL1Q9UHV5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms