Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASS4Q9NQ75 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CASS4Q9NQ75 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms