Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NUDCD1Q96RS6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUDCD1Q96RS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms