Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C12orf42Q96LP6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C12orf42Q96LP6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C12orf42Q96LP6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms