Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SIRT1Q96EB6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SIRT1Q96EB6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SIRT1Q96EB6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms