Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTL3Q8N8U3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL3Q8N8U3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL3Q8N8U3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms