Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRSAM1Q6UWE0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms