Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q3C1V9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q3C1V9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q3C1V9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q3C1V9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q3C1V9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q3C1V9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q3C1V9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q3C1V9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q3C1V9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q3C1V9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms