Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KIAA0040Q15053 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KIAA0040Q15053 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms