Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
GRIN2AQ12879 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
GRIN2AQ12879 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
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