Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL15A1P39059 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
COL15A1P39059 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COL15A1P39059 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COL15A1P39059 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL15A1P39059 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms