Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GTF2E1P29083 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2E1P29083 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2E1P29083 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms