Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RXRAP19793 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RXRAP19793 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RXRAP19793 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RXRAP19793 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RXRAP19793 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RXRAP19793 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RXRAP19793 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RXRAP19793 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms